2023年7月11-13日，由國(guó)家生物技術(shù)創(chuàng)新中心與同寫意聯(lián)袂主辦的第四屆全球生物醫(yī)藥前沿技術(shù)大會(huì)暨展覽會(huì)在蘇州國(guó)際博覽中心召開，速石科技攜旗下CADD/AIDD新藥研發(fā)云平臺(tái)參展，并在小分子藥物開發(fā)論壇上發(fā)表主題演講。

源頭創(chuàng)新是醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)長(zhǎng)久發(fā)展的必由之路，而前沿技術(shù)則預(yù)示著產(chǎn)業(yè)格局變化的方向與未來(lái)。本次大會(huì)以“為生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)注入源頭活水”為主題，匯聚海內(nèi)外院士科學(xué)家、醫(yī)藥上市企業(yè)董事長(zhǎng)與投資機(jī)構(gòu)創(chuàng)始人，全面展示了國(guó)內(nèi)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新領(lǐng)域的最新成果。

作為早期藥物發(fā)現(xiàn)的重要助力手段，CADD/AIDD（計(jì)算機(jī)/人工智能輔助藥物發(fā)現(xiàn)）在靶點(diǎn)識(shí)別與驗(yàn)證、先導(dǎo)化合物發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化等階段能大幅提升新藥研發(fā)的效率，如何用好CADD/AIDD，是生命科學(xué)行業(yè)的一個(gè)長(zhǎng)期命題。

一直以來(lái)，CADD/AIDD都面臨著Workflow定制化程度高、分子庫(kù)數(shù)據(jù)構(gòu)建門檻高、藥物研發(fā)周期長(zhǎng)、算力需求高、研發(fā)環(huán)境手動(dòng)維護(hù)困難等諸多挑戰(zhàn)，這也成為了掣肘藥企使用該技術(shù)的重要原因。

對(duì)此，速石科技高級(jí)技術(shù)顧問(wèn)張大成為與會(huì)嘉賓帶來(lái)了名為《速石科技CADD/AIDD新藥研發(fā)云平臺(tái)，助力新藥研發(fā)企業(yè)提升研發(fā)效率》的主題演講，該平臺(tái)由速石科技自主研發(fā)，可為藥企提供一整套即開即用的研發(fā)環(huán)境，并基于主流公有云廠商資源提供海量云端彈性算力

資源，并針對(duì)藥企使用CADD/AIDD的痛點(diǎn)進(jìn)行了針對(duì)性設(shè)計(jì)：

1、支持主流新藥研發(fā)應(yīng)用與AI框架

平臺(tái)可支持市面上所有主流新藥研發(fā)應(yīng)用，同時(shí)支持AlphaFold、RoseTTAFold等常用AI框架所需資料和快速環(huán)境的搭建，并支持更多組件按需集成。

2、開箱即用的開源分子庫(kù)

速石科技為有需求的藥企提供Zinc、Drugbank、Maybridge、Enamine等開源分子庫(kù)數(shù)據(jù)整理服務(wù)，不僅能開箱即用，還可通過(guò)分子庫(kù)索引系統(tǒng)進(jìn)行一鍵定位。

3、海內(nèi)外多地協(xié)同研發(fā)

針對(duì)大型藥企的多地協(xié)同研發(fā)需求，平臺(tái)可提供統(tǒng)一用戶管理、數(shù)據(jù)管理、快速連接，幫助用戶快速建立多地分支機(jī)構(gòu)Office網(wǎng)絡(luò)，并特別提供海外站點(diǎn)加速，支持多地/海內(nèi)外協(xié)同研發(fā)。

4、專業(yè)的BIO-IT支持

速石科技擁有專業(yè)的BIO-IT能力輸出經(jīng)驗(yàn)，可提供云上BIO-IT環(huán)境構(gòu)建、故障響應(yīng)、技術(shù)支持和使用咨詢服務(wù)，幫助廣大藥企優(yōu)化藥物設(shè)計(jì)流程環(huán)境。

5、數(shù)據(jù)安全管理體系

速石科技提供多種加密手段、靈活的數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)管控與日志安全審計(jì)功能，可充分保障用戶研發(fā)數(shù)據(jù)安全。

6、任務(wù)自動(dòng)溢出到云

平臺(tái)支持混合云模式，無(wú)需復(fù)雜設(shè)置與操作，任務(wù)可動(dòng)態(tài)溢出到云，自動(dòng)化構(gòu)建并銷毀集群。

截止目前，速石科技基于CADD/AIDD新藥研發(fā)云平臺(tái)為包括恒瑞醫(yī)藥、先聲藥業(yè)、加科思藥業(yè)、微芯生物、強(qiáng)聯(lián)智創(chuàng)等在內(nèi)的多家不同類型的醫(yī)藥行業(yè)客戶提供了整體解決方案，幫助其大幅提升新藥研發(fā)效率。

未來(lái)，速石科技將堅(jiān)持走在技術(shù)創(chuàng)新的前沿，為藥企提供一站式的藥物研發(fā)環(huán)境，優(yōu)化應(yīng)用效率，極大縮短新藥研發(fā)的全生命周期，積極推動(dòng)創(chuàng)新藥作為產(chǎn)業(yè)發(fā)展新的動(dòng)能，為國(guó)產(chǎn)創(chuàng)新藥的崛起貢獻(xiàn)自己的力量。

關(guān)于速石科技

速石科技（fastone）致力于構(gòu)建為應(yīng)用定義的云，讓任何應(yīng)用程序，始終以自動(dòng)化、更優(yōu)化和可擴(kuò)展的方式，在任何基礎(chǔ)架構(gòu)上運(yùn)行。

我們?yōu)閯?chuàng)新驅(qū)動(dòng)型用戶提供（CADD/AIDD）新藥研發(fā)云平臺(tái)，滿足新藥研發(fā)等企業(yè)及高校科研機(jī)構(gòu)多種研發(fā)場(chǎng)景需求。基于本地+公有混合云環(huán)境的靈活部署及交付，幫助用戶提升20倍研發(fā)效率，降低成本達(dá)到75%以上，加快市場(chǎng)響應(yīng)速度，面向全球開展競(jìng)爭(zhēng)。

創(chuàng)新藥內(nèi)卷嚴(yán)重，九死一生，而且燒錢速度驚人。
不管Big Pharma還是Biotech都?jí)毫ι酱螅N售額、利潤(rùn)要漲，研發(fā)費(fèi)用要邊漲邊控。
Biotech求活下去，求快速具備造血能力；
Big Pharma求踩穩(wěn)創(chuàng)新藥這一條新成長(zhǎng)曲線，探索國(guó)際化的發(fā)展模式。

如何做到：
速度要快，姿勢(shì)還要帥？

第一：堆新藥研發(fā)人才

自己培養(yǎng)和直接搶人，這兩條路一般同時(shí)進(jìn)行。
培養(yǎng)一個(gè)新藥研發(fā)人才和培養(yǎng)一個(gè)飛行員差不多，得用昂貴的試飛成本才能換來(lái)一點(diǎn)感覺。
外部就從跨國(guó)藥企搶，從大廠搶。既要懂研發(fā)，還要懂市場(chǎng)，最好還要懂資本的多面手，最重要的是，要留得住。

第二：外包，買現(xiàn)成管線

一定程度上解決問(wèn)題，快是快了，但終究不是長(zhǎng)久之計(jì)。
而且核心知識(shí)產(chǎn)權(quán)不在自己手上，姿勢(shì)不夠帥。

第三：堆CADD/AIDD人才

關(guān)于為什么CADD（計(jì)算機(jī)輔助藥物研發(fā)）/AIDD（AI輔助藥物研發(fā)）能夠加速新藥研發(fā)進(jìn)展，去年，我們?cè)谶@篇《 【2021版】全球44家頂尖藥企AI輔助藥物研發(fā)行動(dòng)白皮書 》里已經(jīng)解釋過(guò)了，不再贅述。

CADD和AIDD的區(qū)別就是，一個(gè)重“人工”，一個(gè)重“智能”。
不必取舍，兩者殊途同歸。

國(guó)內(nèi)企業(yè)在找CADD/AIDD人才方面現(xiàn)在是什么情況？
我們?cè)趪?guó)內(nèi)9個(gè)主流招聘平臺(tái)，相隔半年先后調(diào)查了兩次，一共覆蓋134家公司，職位關(guān)鍵詞包括：AI、人工智能、CADD、計(jì)算化學(xué)等。
再說(shuō)一遍：“別看他的眼睛，你看他的手”，行動(dòng)永遠(yuǎn)勝過(guò)言語(yǔ)。

結(jié)論如下：

1、招聘CADD/AIDD相關(guān)職位的公司總量從78家增加到了106家，增幅36%；

2、半年內(nèi)實(shí)際新增招聘公司數(shù)量，56家；

3、八成以上公司明確表示正在進(jìn)行創(chuàng)新藥研發(fā)，其中近四分之一應(yīng)用了AI技術(shù)；

4、2014年以后成立的公司明確表示使用AI技術(shù)的比例大幅提升；

5、30家公司正在招聘CADD/AIDD團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人，占比28%，其中有9家在JD中明確提出要組建CADD/AIDD新團(tuán)隊(duì)；

6、最受歡迎CADD/AIDD應(yīng)用前三名：Schrodinger、MOE和AutoDock。

第三plus：堆資源，或者找個(gè)新藥研發(fā)平臺(tái)？

為啥堆資源就快了？

1、充足的資源會(huì)給研發(fā)人員帶來(lái)充足的想象力和試錯(cuò)空間，而不是束手束腳施展不開。
就像有人問(wèn)一位Google芯片設(shè)計(jì)師：在Google做芯片，是一種什么體驗(yàn)？他說(shuō)：就像小朋友走進(jìn)了一家糖果店，開心瘋了。（做芯片設(shè)計(jì)也是需要大量資源的

2、充足的資源能夠提供更高的計(jì)算精度和準(zhǔn)確性，提高結(jié)果的質(zhì)量和可用性。2020年3月，哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院在《Nature》發(fā)表的論文《An open-source drug discovery platform enables ultra-large virtual screens》就明確推導(dǎo)了真陽(yáng)性率與所篩選化合物數(shù)量的函數(shù)關(guān)系的概率模型，證明：化合物的最高打分隨著規(guī)模增加而提高。

作者分別從10萬(wàn)、100萬(wàn)、1000萬(wàn)、1億、10億個(gè)化合物中進(jìn)行了5次篩選，挑選了得分最高的前50個(gè)化合物進(jìn)行對(duì)比，從圖中可以很清楚地看到篩選的規(guī)模越大，得分越高（位置越靠上）。具體可以看這篇《15小時(shí)虛擬篩選10億分子，《Nature》+HMS驗(yàn)證云端新藥研發(fā)未來(lái)》

3、出結(jié)果快。

比如我們幫助一家大型藥企使用AutoDock Vina對(duì)整個(gè)VS數(shù)據(jù)庫(kù)（2800萬(wàn)個(gè)分子）做小分子對(duì)接，本地104核CPU需2.6至5年，在云上自動(dòng)化構(gòu)建并調(diào)度10萬(wàn)核大規(guī)模算力集群后只用15.23小時(shí)就完成了所有任務(wù)。

去哪里堆？
企業(yè)自己采購(gòu)機(jī)器，搞機(jī)房，或者直接用云，都可以。 

那么，直接找個(gè)新藥研發(fā)平臺(tái)呢？
讓CADD/AIDD研發(fā)人員不用身兼數(shù)職，甚至要干運(yùn)維的活；
更輕松、高效地獲取超大規(guī)模資源，還可以自動(dòng)化變大變小彈性伸縮；
Workflow自定義制作模板，降低團(tuán)隊(duì)整體學(xué)習(xí)和溝通成本；自動(dòng)化的方式替代人工，提高研發(fā)整體效率和管理效率。

做創(chuàng)新藥已經(jīng)夠難了，充滿了不確定性。讓其他事情變簡(jiǎn)單點(diǎn)？

先看幾個(gè)成果：

更多你想要的答案，這里應(yīng)該都有

新藥研發(fā)平臺(tái)37問(wèn)

一、云平臺(tái)支持哪些CADD/AIDD場(chǎng)景？
二、云平臺(tái)支持哪些應(yīng)用？支持自定義工作流嗎？
三、對(duì)CADD/AIDD研發(fā)部門來(lái)說(shuō)，有哪些好處？
四、對(duì)IT部門來(lái)說(shuō)，有哪些好處？

一、云平臺(tái)支持哪些CADD/AIDD場(chǎng)景？

1、如何支持AIDD場(chǎng)景？
在AIDD方面，我們支持AlphaFold、RoseTTAFold等常用AI框架所需資料和快速環(huán)境的搭建，并支持更多組件按需集成。

2、平臺(tái)支持分子對(duì)接嗎？支持基因測(cè)序嗎？還支持哪些CADD場(chǎng)景？平臺(tái)可支持CADD中典型場(chǎng)景分子動(dòng)力學(xué)模擬、分子對(duì)接、虛擬篩選等，并支持單細(xì)胞測(cè)序、全基因測(cè)序場(chǎng)景。 

3、蛋白與蛋白docking可以在平臺(tái)中運(yùn)行嗎？DOCK發(fā)展到現(xiàn)在整合多步驟的HADDOCK、ClusPro、SwamDock、RosettaDock等等，該領(lǐng)域的算法不斷地升級(jí)迭代。平臺(tái)也能夠很方便地集成相關(guān)軟件，提供驗(yàn)證環(huán)境。 

4、想要通過(guò)平臺(tái)篩選一些特定結(jié)構(gòu)的分子，是否可以優(yōu)化化合物庫(kù)？如果您能夠提供確切信息，可以一同討論優(yōu)化。同時(shí)，我們也準(zhǔn)備了很多開源的分子庫(kù)供大家使用，現(xiàn)在已支持Zinc、Drugbank、Maybridge、Enamine等。 

5、目前平臺(tái)中是否有自建的化合物數(shù)據(jù)庫(kù)？
CADD研究過(guò)程中，不論是靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化、還是先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化，開源的分子庫(kù)是必不可少的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。目前開源的分子庫(kù)數(shù)據(jù)分散各地，下載緩慢，格式不統(tǒng)一，更新頻率不等，導(dǎo)致無(wú)法統(tǒng)一使用和管理，數(shù)據(jù)資產(chǎn)作用發(fā)揮有限。所以我們構(gòu)建了fastone自有的分子庫(kù)，并做好了進(jìn)一步的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備。
例如：
1、數(shù)據(jù)預(yù)處理，合并或格式轉(zhuǎn)換；
2、數(shù)據(jù)后處理，去重或力場(chǎng)優(yōu)化。

 6、你們可以協(xié)助做小分子設(shè)計(jì)嗎？
我們不直接提供具體的小分子設(shè)計(jì)，我們負(fù)責(zé)搭建IT和信息平臺(tái)，協(xié)助您完成相關(guān)的研發(fā)工作。

 7、基因數(shù)據(jù)量很大，平臺(tái)有什么好的解決辦法？
對(duì)于GB級(jí)別的增量數(shù)據(jù)，我們支持以混合云組網(wǎng)專線的方式優(yōu)化上傳線路。傳輸通道使用DM工具，支持全自動(dòng)化數(shù)據(jù)上傳，可充分利用帶寬，幫助用戶快速上傳、下載海量數(shù)據(jù)。
對(duì)于PB級(jí)別的存量數(shù)據(jù)，建議通過(guò)離線方式快速傳輸。 

8、最終結(jié)果能否在線可視化查看？
平臺(tái)支持圖片、表格、HTML等多種形式展現(xiàn)。

二、云平臺(tái)支持哪些應(yīng)用？支持自定義工作流嗎？

9、云平臺(tái)能覆蓋到我常用的軟件嗎？我們支持常用的生物/化學(xué)計(jì)算類應(yīng)用，包括：生物化學(xué)與分子生物學(xué)/化學(xué)工程/生物化學(xué)/應(yīng)用化學(xué)/生物工程/藥物化學(xué)/分析化學(xué)/物理化學(xué)/高分子化學(xué)與物理。 

10、具體來(lái)說(shuō)，支持哪些生物/化學(xué)計(jì)算類應(yīng)用/工具？我們支持幾乎所有的生物/化學(xué)計(jì)算類應(yīng)用/工具，包括：AutoDockVina、Amber、FastQC、DeltaVina、GATK、Gromacs、Schr?dinger、NetMHC、Rosetta、BCFtools等。

更多支持應(yīng)用列表，歡迎文末掃碼添加小F獲取。

11、你們支持Alphafold嗎？
我們可以快速提供Alphafold等常用環(huán)境，方便用戶快速進(jìn)行后續(xù)研究。

12、我們用的軟件是自己編譯的，你們平臺(tái)支持嗎？
支持。我們提供的集群環(huán)境鏡像已包含常見應(yīng)用工具運(yùn)行所需的依賴庫(kù)，用戶也可以自行安裝配置。

13、對(duì)于一些商業(yè)軟件例如Schr?dinger，你們提供License嗎？
商業(yè)軟件的License文件需要客戶自行提供，fastone提供License Server進(jìn)行統(tǒng)一管理。

14、分子對(duì)接流程能不能自定義？上云之后每次都要重新弄一遍嗎？
很多時(shí)候，現(xiàn)成的應(yīng)用往往無(wú)法滿足用戶的需求，需要根據(jù)自己的模型和研究目標(biāo)，自定義設(shè)置一套獨(dú)有的工作流程。
特別是新藥研發(fā)所涉及的應(yīng)用上，可以說(shuō)幾乎沒有一模一樣的工作流。 我們已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了多款應(yīng)用（如Vina、Amber）的自定義工作流，可以根據(jù)用戶的實(shí)際使用場(chǎng)景（包括入?yún)⑽募⒔Y(jié)果文件、流程使用方式、步驟以及相關(guān)說(shuō)明等）實(shí)現(xiàn)自定義模板和腳本自動(dòng)化。用戶也可以提供腳本，由我們協(xié)助完成并行化改造。

15、你們是否提供固定的工作流模板？
提供。
用戶在進(jìn)行了一次或多次復(fù)雜的設(shè)定之后，能把這些設(shè)定保存成固定模板，不用重復(fù)手動(dòng)去一步步重新設(shè)置。一次制作，反復(fù)使用，省時(shí)省力，還不用擔(dān)心中間出錯(cuò)。而且，這套自定義的設(shè)置是可以跨應(yīng)用存在的，不一定局限在一個(gè)應(yīng)用范圍內(nèi)。自己重復(fù)用，共享給團(tuán)隊(duì)的其他人用，都可以。

16、你們是怎么幫助我們做工作流優(yōu)化的？
我們有通用的框架。我們也有對(duì)應(yīng)的CADD專家，可理解您的業(yè)務(wù)需求，快速設(shè)計(jì)出合理的相關(guān)流程。 

17、你們的云平臺(tái)如何與CADD應(yīng)用相結(jié)合適配？
我們提供兩種模式進(jìn)行適配：任務(wù)模式和集群模式。
集群模式為用戶提供了一個(gè)靈活的環(huán)境，用戶可在集群模式下進(jìn)行一系列的調(diào)整和優(yōu)化，自由度非常高。
如果您習(xí)慣使用圖形化界面操作，我們也提供圖形桌面，您可通過(guò)Web瀏覽器啟動(dòng)集群，跳轉(zhuǎn)到虛擬桌面，并可在該桌面直接操作應(yīng)用進(jìn)行相應(yīng)設(shè)置以開啟云端任務(wù)。當(dāng)用戶在集群模式下跑通了之后，可以選擇將整個(gè)流程固化下來(lái)，方便更多研發(fā)人員使用。此時(shí)我們可以幫助用戶將此套流程轉(zhuǎn)換成固定的任務(wù)模式，讓更多的人可以使用這個(gè)成熟的框架，從而加速后續(xù)的整體研發(fā)效率。

三、對(duì)AIDD/CADD研發(fā)部門來(lái)說(shuō)，有哪些好處？

18、你們的平臺(tái)容易操作嗎？用起來(lái)會(huì)不會(huì)很麻煩？
我們?yōu)锳IDD/CADD研發(fā)人員提供了一整套即開即用的新藥研發(fā)環(huán)境，從登錄桌面、打開應(yīng)用、配置、提交任務(wù)、自動(dòng)上云開機(jī)運(yùn)行任務(wù)并自動(dòng)關(guān)機(jī)、查看結(jié)果進(jìn)行調(diào)試……用戶所需要的操作與本地幾乎完全一致，每一步只需在平臺(tái)上使用鼠標(biāo)簡(jiǎn)單點(diǎn)選即可完成。、

 19、有些應(yīng)用需要先跑完主任務(wù)再跑其他任務(wù)，上云可以智能化跑任務(wù)嗎？
有些應(yīng)用在運(yùn)算時(shí)存在依從機(jī)制，每若干個(gè)任務(wù)中包含1個(gè)主任務(wù)，只有當(dāng)主任務(wù)運(yùn)行結(jié)束后，其他任務(wù)才能開始并行運(yùn)算。
由于任務(wù)有先后，所以需要先跑主任務(wù)，在每個(gè)主任務(wù)完成之后自動(dòng)調(diào)度資源并行運(yùn)算其他任務(wù)。
而不同任務(wù)完成時(shí)間可能不同，對(duì)資源的需求量可能時(shí)高時(shí)低有波動(dòng)，最終結(jié)束關(guān)機(jī)時(shí)間也不同。
我們使用Slurm調(diào)度器按順序調(diào)度任務(wù)排隊(duì)，Auto-Scale功能可自動(dòng)監(jiān)控任務(wù)和資源需求，動(dòng)態(tài)按需地開啟與關(guān)閉所需資源。詳細(xì)的自動(dòng)化過(guò)程可參考27問(wèn)。

20、做分子對(duì)接，動(dòng)不動(dòng)就是幾百萬(wàn)上千萬(wàn)個(gè)分子，太貴了，有節(jié)約成本的方案嗎？
分子對(duì)接規(guī)模如果巨大，有什么好的解決辦法能加快這個(gè)過(guò)程？怎么做到的？分子對(duì)接的一大特征是任務(wù)數(shù)量龐大而單個(gè)任務(wù)計(jì)算時(shí)間短，單個(gè)分子對(duì)接的時(shí)間通常在幾分鐘以內(nèi)（與參數(shù)設(shè)置有關(guān)）。
這一特征天然匹配云端的SPOT實(shí)例。
當(dāng)便宜且隨時(shí)可能被搶占中斷的SPOT實(shí)例遇到迷你卻海量的分子對(duì)接任務(wù)，簡(jiǎn)直就是天造地設(shè)的一對(duì)。
1、常規(guī)分子對(duì)接任務(wù)幾分鐘即可算完，特別適合SPOT這種分分鐘可能被搶走的狀態(tài)；
2、fastone平臺(tái)具備自動(dòng)重試功能，一個(gè)任務(wù)被中斷可以自動(dòng)重新提交，任務(wù)之間互相不影響，重新提交單個(gè)任務(wù)影響很小。詳見《生信云實(shí)證Vol.3：提速2920倍！用AutoDock Vina對(duì)接2800萬(wàn)個(gè)分子》

21、任務(wù)量比較大，想提前預(yù)估一下費(fèi)用再做決策，有沒有什么好辦法？
我們平臺(tái)預(yù)設(shè)了智能預(yù)測(cè)功能，以MOE為例。
用戶在fastone平臺(tái)的圖形化操作界面運(yùn)算MOE任務(wù)，完成以下步驟：
1、用戶上傳數(shù)據(jù)文件（平臺(tái)自動(dòng)解析文件，判斷其中包含的分子數(shù)量）
2、用戶輸入期望的運(yùn)算時(shí)間（平臺(tái)推薦用戶適配機(jī)型或用戶自行選擇機(jī)型）
3、系統(tǒng)得出預(yù)測(cè)成本

項(xiàng)目負(fù)責(zé)人能夠非常方便地使用該功能預(yù)估項(xiàng)目費(fèi)用，完成項(xiàng)目規(guī)劃和申請(qǐng)。 

22、我要跑TPU，你們支持嗎？
支持。
用戶可以通過(guò)我們平臺(tái)獲取到TPU資源。

23、有時(shí)會(huì)遇到CADD模擬出的結(jié)果與實(shí)際結(jié)果有一定出入，這是為什么？
CADD本身是模擬的結(jié)果，通過(guò)不斷的迭代，力場(chǎng)的優(yōu)化，會(huì)不斷接近實(shí)際情況。CADD和實(shí)際的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)相結(jié)合，反復(fù)設(shè)計(jì)和迭代，可以達(dá)到很好的效果。

24、有些任務(wù)需要使用大量的GPU資源，你們有嗎？
當(dāng)單個(gè)云廠商的GPU資源難以滿足需求時(shí)，我們會(huì)根據(jù)用戶任務(wù)需要和特性，跨多家公有云廠商，智能自動(dòng)化調(diào)度云端GPU異構(gòu)資源，保證用戶對(duì)GPU的需求得到滿足。

 25、GPU資源很貴，有沒有節(jié)約成本的方案？
GPU資源在不同云廠商之間有著顯著的差異，而且往往資源多的售價(jià)高，便宜的資源少，同時(shí)兼顧成本和效率是必須要考慮的問(wèn)題。以各大公有云廠商在北京地區(qū)的GPU實(shí)例（V100）按需價(jià)格為例，最高價(jià)格超過(guò)最低價(jià)2倍。

我們平臺(tái)可綜合考量用戶對(duì)完成任務(wù)所需時(shí)間和成本的具體要求，在多個(gè)云廠商的資源之間選擇最適配的組合方案，為用戶跨地區(qū)、跨云廠商調(diào)度所需資源。

26、用Amber跑任務(wù)，用GPU跑非常快，但是有時(shí)候會(huì)跑失敗，用CPU雖然穩(wěn)定但是慢，你們?cè)趺唇鉀Q？
這是Amber18版本的固有問(wèn)題，在使用GPU時(shí)計(jì)算時(shí)有10-15%概率失敗，需要及時(shí)調(diào)度CPU資源重新計(jì)算。我們平臺(tái)支持優(yōu)先使用GPU計(jì)算，當(dāng)任務(wù)失敗時(shí)，自動(dòng)調(diào)用CPU重新計(jì)算。
該問(wèn)題已在Amber20中修復(fù)。

四、對(duì)IT部門來(lái)說(shuō)，有哪些好處？

27、現(xiàn)在公司里才幾臺(tái)機(jī)器，天天維護(hù)頭就很大了，云上這么多機(jī)器還不得把自己搞禿了？
云上的運(yùn)行環(huán)境都是自動(dòng)化配置的，不需要人工干預(yù)，用戶還可以通過(guò)平臺(tái)進(jìn)行統(tǒng)一管理和監(jiān)控，方便易操作。
舉個(gè)例子，我們的Auto-Scale功能可以自動(dòng)監(jiān)控用戶提交的任務(wù)數(shù)量和資源的需求，動(dòng)態(tài)按需地開啟和關(guān)閉所需算力資源，在不夠的時(shí)候，還能根據(jù)不同的用戶策略，自動(dòng)化調(diào)度本區(qū)域及其他區(qū)域的目標(biāo)類型或相似類型實(shí)例資源。所有操作都是自動(dòng)化完成，無(wú)需用戶干預(yù)。
下圖就是開啟Auto-Scale功能后，用戶某項(xiàng)目一周之內(nèi)所調(diào)用云端計(jì)算資源的動(dòng)態(tài)情況。
其中橙色曲線為OD實(shí)例的使用狀況，紅色曲線為SPOT的使用狀況。

Auto-Scale功能可以根據(jù)任務(wù)運(yùn)算情況動(dòng)態(tài)開啟云端資源，并在波峰過(guò)去后自動(dòng)關(guān)閉，讓資源的使用隨著用戶的需求自動(dòng)擴(kuò)張及縮小，最大程度匹配任務(wù)需求。

28、你們是什么存儲(chǔ)策略？費(fèi)用呢？冷存儲(chǔ)和熱存儲(chǔ)的費(fèi)用是不一樣的，我們會(huì)根據(jù)用戶的情況提供個(gè)性化的解決方案。

29、數(shù)據(jù)備份的頻率如何？最高可以達(dá)到多少？現(xiàn)有策略怎樣？默認(rèn)每周六進(jìn)行數(shù)據(jù)備份，也可以根據(jù)客戶需求按天或按小時(shí)備份。

30、使用平臺(tái)的工作人員比較多，能否對(duì)每個(gè)人設(shè)置使用資源的上限？
fastone平臺(tái)的權(quán)限和角色管理功能，支持管理員角色對(duì)每一個(gè)用戶進(jìn)行相關(guān)權(quán)限設(shè)定，包括預(yù)算使用上限和CPU核數(shù)使用上限，從而在全局角度管控項(xiàng)目的資源消耗。該功能與智能預(yù)測(cè)配合使用，能夠從多個(gè)層面對(duì)預(yù)算和資源進(jìn)行全方位規(guī)劃。

31、公司里還有些機(jī)器能用，你們支持混合云模式嗎？
支持。
可以將本地機(jī)器做成集群，也可以基于本地機(jī)器搭建混合云平臺(tái)。我們支持本地資源不足的時(shí)候，自動(dòng)溢出到云上。

32、你們?cè)趺磳?shí)現(xiàn)混合云？
云資源和本地之間通過(guò)安全的數(shù)據(jù)通道連接，所有資源在fastone平臺(tái)統(tǒng)一管理，有統(tǒng)一視圖，并按需智能調(diào)度，不改變用戶的使用習(xí)慣。

 33、公司里已經(jīng)有機(jī)器了，再增加一套云環(huán)境，IT管理上會(huì)不會(huì)變麻煩？通過(guò)我們可以在不增加負(fù)擔(dān)的情況下對(duì)接多云，減少IT管理壓力。我們的自動(dòng)化管理平臺(tái)很容易上手，對(duì)提升研發(fā)效率和資源利用率都有很大幫助。

34、我們公司有海外研發(fā)部門，用你們平臺(tái)方便嗎？
我們的平臺(tái)支持全球部署，我們會(huì)全球的優(yōu)化組網(wǎng)，統(tǒng)一用戶管理，數(shù)據(jù)管理，優(yōu)化的遠(yuǎn)程接入方式，保持一致的用戶體驗(yàn)。

35、云上云下的安全如何保障？
安全是一個(gè)立體的概念，包括系統(tǒng)安全、應(yīng)用安全、流程安全、數(shù)據(jù)安全等很多方面。
云的基礎(chǔ)架構(gòu)和傳統(tǒng)IT架構(gòu)在安全方面并沒有本質(zhì)上的區(qū)別，依然是利用計(jì)算節(jié)點(diǎn)和存儲(chǔ)資源。很多人覺得這兩者之間存在差異，我們認(rèn)為這取決于個(gè)人的認(rèn)知。本地的安全措施在云上都可以實(shí)現(xiàn)，同時(shí)云廠商本身還提供更強(qiáng)大的安全保障。

 36、數(shù)據(jù)安全如何實(shí)現(xiàn)？
數(shù)據(jù)全部通過(guò)安全協(xié)議傳輸，并支持RBAC的數(shù)據(jù)訪問(wèn)認(rèn)證鑒權(quán)。同時(shí)，我們還支持?jǐn)?shù)據(jù)加密存儲(chǔ)，算法可自定義。

- END -

我們有個(gè)新藥研發(fā)云平臺(tái)
集成多種生命科學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用，大量任務(wù)多節(jié)點(diǎn)并行
應(yīng)對(duì)短時(shí)間爆發(fā)性需求，連網(wǎng)即用
跑任務(wù)快，原來(lái)幾個(gè)月甚至幾年，現(xiàn)在只需幾小時(shí)
快速上手，拖拉點(diǎn)選可視化界面，無(wú)需代碼
支持高級(jí)用戶直接在云端創(chuàng)建集群 

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