生信實證系列Vol.15:如何用AlphaFold2,啪,一鍵預(yù)測100+蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
"結(jié)構(gòu)就是功能"——蛋白質(zhì)的工作原理和作用取決于其3D形狀。 2020年末,基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的AlphaFold2,一舉破解了 …
"結(jié)構(gòu)就是功能"——蛋白質(zhì)的工作原理和作用取決于其3D形狀。 2020年末,基于深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的AlphaFold2,一舉破解了 …
創(chuàng)新藥內(nèi)卷嚴(yán)重,九死一生,而且燒錢速度驚人。不管Big Pharma還是Biotech都壓力山大,銷售額、利潤要漲,研發(fā)費 …
“得益于速石平臺的Auto-Scale功能,我們的AutoDock Vina工作負載能夠溢出到云端進行計算,數(shù)分鐘就能完成1000+節(jié)點的并行計算。”
效率提升
成本節(jié)約
“fastone為我們提供了一個即開即用的云端研發(fā)環(huán)境,主要幫我們做到了兩件事情: 一是合理的任務(wù)拆分,二是調(diào)度了大量的云資源。最終跑完任務(wù)只用了不到一天,費用也很合理。”
本地計算周期
云端耗時
“以往CAE部門都是采用單機模式計算,算得慢是一方面,大家還都喜歡爭搶配置高的機器。速石科技的方案解決了這一問題,提升了我們的模擬性能,操作方式也不用改變。”
應(yīng)用性能提升
任務(wù)文件傳輸
“分布式訓(xùn)練需要大量的GPU資源,通過傳統(tǒng)渠道幾乎不可能在短時間內(nèi)獲得這么多GPU,成本也非常高。通過速石平臺,我們不僅獲得了足夠數(shù)量的GPU,操作方式也非常簡單。”
新型號GPU
訓(xùn)練時間
“因項目結(jié)題需要,必須在一周內(nèi)完成10多個case的運算,我們實驗室的機器只有80核,這時候去租超算也來不及了,幸好速石平臺為我們快速調(diào)來了足夠的資源,配置也很貼合計算需求,而且還不用排隊。”
資源
排隊
“速石平臺幫助我們快速準(zhǔn)確地處理與分析了大規(guī)模數(shù)據(jù),從高頻交易到風(fēng)險合規(guī)性,充分判斷了走勢、風(fēng)險和盈利,這讓我們從數(shù)據(jù)中獲取了更多深刻見解。”
資源保障
資源證書
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